A PRODEPA desenvolve um programa de migração gradativa das estações de trabalho e dos servidores do Estado para a tecnologia de software livre.

Com o objetivo de otimizar o desempenho, aumentar a produtividade e a segurança, além de economizar recursos públicos que podem ser investidos em outras áreas do governo, a empresa elabora projetos, treina e faz migrações de parques computacionais de outras tecnologias para sistemas que utilizam software livre.

Em 2007, realizou a migração de diversos servidores e serviços que utilizavam tecnologia fechada e paga para sistemas com software livre, tornando as soluções mais abertas para configuração e suporte, possibilitando melhor desempenho e aumento de produtividade.

O maior exemplo é o serviço de correio Expresso-PA, onde o correio eletrônico, hoje ferramenta essencial para a área administrativa de qualquer órgão ou empresa, passou a ser um serviço oferecido aos órgãos do Estado sem custos, em virtude da sua nova plataforma tecnológica.